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目录

1. 第一篇博硕士论文范文参考：基于子公司视角的央企集团管控模式选择研究
2. 第二篇博硕士论文样文：高等学校中的社会性别偏差问题与性别意识教育研究
3. 第三篇博硕士论文范文模板：基于软分类的太湖水体叶绿素a浓度遥感反演与长时间序列分析
4. 第四篇博硕士论文范例：W型火焰锅炉燃用无烟煤低NOx燃烧技术机理和模化试验研究
5. 第五篇博硕士论文范文格式：极化电荷的发展、应用以及生物大分子体系分子动力学模拟的研究

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第一篇博硕士论文范文参考：基于子公司视角的央企集团管控模式选择研究

随着全球化分工的加速,市场竞争越来越激烈,企业改革也越来越深化,企业不但不断朝规模化发展,企业间的整合并购步伐也纷纷加快,不同规模、不同行业、不同所有制的企业都开始出现整合,目的就是为了应对市场竞争,谋求规模经济（Economies of scale）和竞争优势（Competitive Advantage）.对于国有企业来讲,在国务院国资委（SASAC）的主导下,改革也在不断深化,在进行管理提升的基础上,2014年国务院国资委又加强国资监管,推出国有资本管理平台的新思路,目的在于强化央企的竞争力,强化内部管控,优化资源配置,提升规模效益,可以说,央企集团已经成为我国国民经济的重要支柱,其公司治理结构完善程度,直接关系着我国以建立现代企业制度为目标的企业改革成败.

母公司对子公司的有效管理,是所有企业集团在发展过程中所必须面临的管理问题,但目前来讲,央企集团在这些方面还做的不到位.对于管控问题,长期以来国内外理论界与实业界都将重点放在上市公司的管控上,对于集团公司内部的管控模式的研究相对较少,即使有部分学者对集团管控模式进行了研究,大部分也将影响因素放在外部环境和母公司方面,较少对子公司的影响因素给予充分的重视,忽视了子公司的重要性.同时,文献中仅仅说明某些因素对管控模式有影响,但对于能够产生何种影响,是正向还是负向,影响程度如何,都缺乏系统论述,可以说,在对影响因素进行有针对地量化分析方面还是较少.

本文在研究路径上,以子公司特征指标为突破口,梳理文献,对相关概念进行界定,剖析企业集团形成的历程和途径,探求问题,提出解决思路,并就子公司特征指标对母公司集权程度的影响提出研究假设,在此基础上,选择部分*企业母公司和子公司做为样本,开展问卷调查研究,运用统计分析,对研究假设进行验证,目的在于寻求合适的解决方法,指导集团公司顺利开展对所属子公司的管控.

本文在文献综述方面,就两条线开展研究,一是母子公司定位与委托*关系确定,二是企业资源能力特征与管控模式选择,围绕企业集团和管控模式两大核心内容,结合企业资源能力和委托*关系开展论述,通过文献综述,提出论文的研究假设.同时对央企集团运行机理和管控机理进行分析,从企业集团和央企集团的形成模式入手,深入分析央企集团管控的途径和存在的问题,就实践中应用最广的操作管控型、战略管控型、财务管控型等三种管控模式（Managementand control model）进行比较,提出管控模式选择的影响因素.

结合研究假设和筛选出的影响因素,开展实证研究.根据子公司特征解释变量与集权分权被解释变量及管控模式的假设前提,设计调研问卷,选择国务院国资委监管的央企集团进行调研,首先进行描述性统计,分析各种变量的特征,进行信度和效度检验,其次进行统计性分析,分别采用相关系数检验和路径检验两种方法,对解释变量和被解释变量之间的相关性进行分析,建立初始路径分析回归方程,采用DW进行检验,将相关性不显著的指标舍弃,重新进行整体路径检验,评价子公司特征指标的直接影响和间接影响,在此基础上,构建影响因素量化模型.

经过实证研究,得到如下研究结论：子公司特征指标对母公司集权程度影响的关系方面,子公司管理水平、核心业务能力、股权比例、贡献程度、在母公司网络体系中的位置和开拓精神都正向母公司集权程度,而子公司拥有的当地政府资源则负向影响母公司集权程度；子公司与母公司的文化一致性、子公司与网络体系中其他公司的交流程度及在网络体系中被替代的程度对母公司的集权程度影响不显著,子公司特征指标对管控模式选择的程度没有直接的影响,而是通过母公司集权程度的间接*作用对其产生影响.

根据影响因素量化模型,结合本人所在的央企集团-中国港中旅集团进行验证,设计具体应用路径,明确实施步骤,从应用效果来看,母子公司管理关系进一步理顺,经营业绩也稳步提升.

本文的研究特点主要有两点：注重定性分析与定量研究相结合,在定性分析基础上对其构建模型,并给出合理的经济解释；注重理论研究与实证研究相结合,将理论模型应用于实际分析验证,确保理论正确性与实用性.

本文的主要创新之处在于：首先,没有拘泥于国内外学者对于外部因素和母公司层面的影响因素进行分析角度,而是基于我国企业集团的实际情况,深入研究子公司影响因素对管控模式选择程度的影响,探求新的研究视角；其次,进行影响因素量化分析,通过调研和统计分析,测定相关影响因素对管控模式的实际影响,明确影响的方向,影响的程度,影响的类型,确认到底是直接影响还是间接影响,构建影响因素量化模型,并用实证加以验证.但由于时间、精力和能力等原因限制,论文研究还存在一定的问题,如实证样本数量偏小、问卷问项设计的不够全面等等,以期在以后的研究中进一步深入和展开.

第二篇博硕士论文样文：高等学校中的社会性别偏差问题与性别意识教育研究

由于在长期的历史发展过程中,在世界范围内曾普遍地存在着男权制的社会制度与文化,一直在社会性别制度乃至整个社会权利关系、社会文化意识的建构中,形成了限制女性以第二性的社会位置而存在的社会意识形态,导致男女*一直在参与高等教育中存在事实上的明显的性别不平等问题.在高等教育领域,自从西方女权运动兴起以后,女性才逐步获得参与高等教育的机会,但时至今日还仍存有许多社会性别偏差问题或性别不平等问题.目前我国高等学校中的社会性别偏差问题或性别不平等问题并未得到实质上的解决,其不良后果从某种程度上衡量或许正日益突出.在高等教育大众化发展的今天,如何有效地消解高等教育中的性别歧视等性别不平等问题以促进高等教育中的性别平等发展,既是一个重要的经济社会问题,也是一个重要的教育理论与实践问题.目前,性别平等发展作为人本发展的根本要求,是最基本的权利关系诉求,是衡量一个民族或社会能否发展的重要尺度和标准,而高等教育的性别平等是实现社会性别平等发展的重要目标之一.因此,围绕研究高等学校中的性别不平等问题而关注大学生的社会性别意识教育问题,分析社会性别意识教育对于重构高校中广大学生尤其是高师院校学生、教师以及管理者的性别社会价值观的意义,探讨高校中实施性别意识教育,从意识形态和人文素养的塑造入手逐步解构高校中的社会性别偏差或不平等问题,消除性别偏见、性别刻板印象等在高校教育中的潜在不利影响是非常必要的,有利于促进高等教育性别平等发展,推进男女平等基本国策在高校教育领域的贯彻落实.本研究从社会性别视角*我国目前高等学校中主要存在的社会性别偏差问题或性别不平等现象,重点探索了导致高等学校中的社会性别偏差问题和影响高校教育性别平等发展的关键因素,阐明将社会性别意识教育纳入高校人才培养体系的重要意义、必要性、可行性,提出将社会性别意识教育纳入高校人才培养体系的理性层面与实践层面的构想,力求为新时代下高校德育与综合素质教育改革、高等教育教师教育改革以及推动高等教育性别平等、构建先进性别文化提供依据和启示.

社会性别与发展理论结合教育性别平等理念是本研究的重要理论基点.社会性别与发展理论尤其关注运用性别分析探索*发展中的不平等性偏差和歧视,为解读和审视人类的知识体系和性别观念提供了新的研究视角和分析方法,其主张和采用的社会性别分析方法现已成为改变不公平的社会性别结构、促进*共同发展的有力工具.在研究和解决高等教育性别偏差问题时,社会性别与发展理论为之提供了新的理论支点和研究视角.本研究以社会性别作为探查教育问题的重要分析手段,将社会性别视角和教育性别偏差问题有机结合,多角度深入剖析了当前制约我国高校教育性别不平等发展的主要问题及其实质,并发现解决高等教育性别偏差问题的主要着力点和突破口.本研究采用文献法和社会性别分析法,在研究中凸显性别向度,立足于我国高等教育性别平等发展的实际进行了深入分析和研究.

本研究主要内容包括五章.第一章围绕将社会性别偏差作为社会问题的厘清,基于女性主义视角进行社会性别的本质阐释,从社会性别观念的创生入手,分析了社会性别为何是反映和解析社会问题的重要范畴,以及社会性别的建构机制与成因；重点探讨了社会性别偏差问题的实质,社会性别偏差问题的产生与性别偏差具象；围绕分析中国传统性别制度、性别文化对社会性别偏差问题的建构,揭示社会性别偏差问题在中国历史中的展延以及在现代中国中的客观存在情况.第二章围绕社会性别如何作为教育问题的诠释,指出社会性别偏差问题是构成教育问题的重要因素与分析教育问题的重要向度；进一步揭示社会性别偏差问题用以解析高等教育公平问题的意蕴,基于社会性别视域探析高等教育中的社会性别偏差问题,摭采社会性别视角*出的高等学校中的社会性别偏差问题众象,重点探析了高等学校中的社会性别偏差问题的主要表现、导致高等学校中的社会性别偏差问题的主要因素和解决问题的主要对策.第三章围绕探析高校实施社会性别意识教育的意蕴及其价值,分析了社会性别意识及其形成,探讨了当代大学生社会性别意识现状,社会性别意识教育的意蕴,以及高校中实施社会性别意识教育的教育价值与社会价值.第四章围绕社会性别意识教育已有的发展概况,比较分析了国外社会性别意识教育的发展概况及经验启示,国内高校社会性别意识教育发展现状及存在的问题；论证了突出社会性别意识教育的女子高校在推动高校性别意识教育中的特殊作用,以及国内外女子高校进行社会性别意识教育的特色示范与实践经验.第五章重点围绕我国高校实施社会性别意识教育的主要目标与措施,探讨建构高校德育的性别意识培养向度、赋予高校专业人才综合素质结构以性别意识、将性别意识教育纳入高师教育主流体系、彰显性别问题学术研究、推动性别意识教育的教育行政管理和规范性别课程体系建设问题；提出建构社会性别发展性高校德育模式,在高校人才培养方案中建构性别意识通识教育和在教师教育中实施性别意识教育的主要措施.

本研究认为,社会性别偏差问题是作为社会问题的客观实在,是诸多社会问题的构成成分,是反映和解析社会问题的重要范畴.性别首先是人类基本社会制度形成的基石,社会性别的影响和作用存在于整个社会所有的制度、机制、组织与行为之中.社会性别偏差问题作为社会问题而存在,表现为*在基本的社会关系中尤其是社会权力关系上出现了人为的不公正、不平等的性别区隔,集中反映在社会各个领域中的社会性别偏差与性别不平等问题.社会性别偏差问题展延在中国漫长历史中也依然是现代中国中的客观实在.社会性别偏差问题是在一定的社会制度体系中以构成性别的符号所表达的社会问题,在本质上反映和解释了性别不平等问题形成与延续的范式.性别制度因素与性别文化因素是形成社会性别的主要因素,社会性别制度对人施加的影响事实上是通过性别文化及其影响下的性别观与性别意识的直接影响得以实现的.其中,性别观是建构性别的价值取向及性别关系的意识根源.性别偏差问题的社会本质在于性别不平等,其形成的直接因素在于传统的性别文化建构形成的社会的与个体的性别观及性别意识.传统性别文化境域、性别形成的主要社会化作用者与个体的社会学习机制之间的动态的循环交互作用是个体性别的社会差异的心理机制.同时,社会性别偏差问题也是作为教育问题的客观实在,是构成教育问题的重要因素与分析教育问题的重要向度.性别平等是构成和评价学校教育公平的重要尺度,是衡量学校教育人本发展的自然维度,是评价学校教育平等的关键指标.教育中的社会性别偏差问题是教育中的最为基本的问题之一.其中,高校教育的性别平等发展问题既是一个教育公平问题,更是一个影响经济社会科学发展的重大问题.在高校教育现实中,尚存在诸多事实上的性别不平等问题.从某种意义上讲,高等教育中的社会性别偏差问题集中体现为女性不平等地参与高等教育的问题.即使在我国高等教育大众化目标逐步实现的当下,由于经济、文化、家庭等条件制约和传统习惯势力的影响,我国女性在平等参与高校教育的诸多宏观或微观层面上仍严重存在着事实上的性别偏差问题,女性接受高校教育在数量、层次和质量等方面,在入学机会、教育过程、教育结果和性别意识现状方面,与男性存在明显性别偏差.聚焦于高等学校领域,高校教育社会性别偏差问题主要形成于教育系统内部,导致的主要外因在于传统性别文化观念.导致高校教育中的社会性别偏差问题和影响高校教育性别平等发展的潜在的最主要的因素在于教育中的传统的性别观念与性别意识,解决上述问题的有效路径将在于在高等学校进行社会性别意识教育.所以,本研究探究了我国高校性别意识教育正确实施和发展应该确立的诸如建构高校德育的性别意识培养向度、赋予高校专业人才综合素质结构以性别意识、将性别意识教育纳入高师教育主流体系、彰显性别问题学术研究、加强性别意识教育的教育行政管理、规范性别课程体系建设等性别意识教育建设要件方面的原则与向度,并论证了建构实施性别意识通识教育的社会性别发展性高校德育模式,建构实施高校性别意识通识教育课程体系的范式和规范管理高校性别意识教师教育的主体方案构想,为推动新时代下高校综合素质教育改革、高师教育改革,规范建设高等学校实施性别意识教育的各个要件,逐步解构、消除高等教育中的性别偏差问题,促进高等教育性别平等发展,构建先进性别文化,推进男女平等基本国策在高等教育领域的贯彻落实,将提供较有力的理论依据和有效的实践参考.

此外,本研究认为,未来的高校性别意识教育研究应围绕性别意识教育的教育学科的学理建构、教学论层面的理论研究与实证研究、高师教师教育研究、教材建设研究以及进行性别意识教育效果检验方面的心理学实证研究等进行更为深入的探索.

第三篇博硕士论文范文模板：基于软分类的太湖水体叶绿素a浓度遥感反演与长时间序列分析

近年来,中国的水体污染问题越来越严重,特别是内陆湖泊的富营养化问题最为突出.叶绿素是影响光合作用的最重要的色素,是水体富营养化的重要指示参量.卫星遥感具有成本低、范围广、速度快、连续性好等优势,在水环境监测中发挥了越来越重要的作用.叶绿素a浓度反演是水色遥感的重要研究内容,而浑浊富营养化内陆水体的叶绿素a浓度反演一直是个难点.本文主要研究内容就是利用遥感技术监测浑浊富营养化的太湖水体的叶绿素a浓度,在此基础上分析其空间分布特点和长时间变化趋势,并初步结合降水、气温、风速等因素解释了太湖叶绿素a浓度的变化规律.

本文在水体光学分类研究的基础上提出了两种基于软分类(模糊分类)的水体叶绿素a浓度反演策略,相应的将已有的叶绿素a浓度反演方法归结为传统反演策略和硬分类反演策略.本文以太湖为研究对象获取大量实测水面光谱数据和MERIS卫星图像,分别实现了基于实测水面光谱的和基于MERIS图像的软分类反演策略,通过对比传统反演策略和硬分类反演策略评价了软分类反演策略的精度.采用精度最高的软分类反演策略,建立了MERIS长时间序列批量数据叶绿素a浓度反演流程,解决了反演过程的关键技术难题.最后,反演了太湖2002～2012年的叶绿素a浓度,分析了十年来太湖叶绿素a浓度的空间分布特征以及年际变化、季节变化和月变化规律与发展趋势.

通过利用实测水面光谱和MERIS图像对不同反演策略的精度检验发现：硬分类反演策略比传统反演策略的精度有所提高,软分类反演策略取得了最好的精度,且普适性最强.十年来,太湖叶绿素a浓度的空间分布呈现从北向南递减的规律；年际变化呈现“W”字形的波动变化趋势；季节变化显著：冬季最低,春季升高,夏季最高,秋季开始降低；月变化规律总体呈现冬季月份低、夏季月份高的“Λ”字形,且以年为周期的波动变化.

本文的主要研究贡献有以下三个方面：

1)提出了4种叶绿素a浓度反演策略,全面评价了4种反演策略的精度,以及不同反演策略下5种基于水面光谱的和12种基于MERIS数据的叶绿素a浓度反演算法的精度,通过比较找到了太湖不同类型水体对应的最优算法和模型.

2)论证了MERIS2P离水辐射产品在太湖的适用性.通过MERIS2P遥感反射率数据与实测遥感反射率的对比分析,评估了其在太湖的适用性.

3)反演了太湖2002～2012年共1932景MERIS数据的叶绿素a浓度,并据此全面分析了十年来太湖叶绿素a浓度的年际变化、季节变化和月变化规律和发展趋势.

本文的创新点主要体现在以下两个方面：

1)创新性地提出了基于软分类的太湖水体叶绿素a浓度反演策略.该反演策略通过最优算法和距离权重的加权融合提高了算法的稳定性、可靠性以及结果的平滑性、连续性.软分类反演策略解决了叶绿素a浓度反演算法的区域性和季节性适用性问题,提高了算法的普适性.

2)创新性地提出了矢量边界辅助下的MERIS数据水体自动提取方法.该方法实现了MERIS数据水体提取阂值的自动化选择,提高了水体提取的精度和对大批量数据的处理效率.

第四篇博硕士论文范例：W型火焰锅炉燃用无烟煤低NOx燃烧技术机理和模化试验研究

煤炭在我国的能源战略上举足轻重,在S02得到有效控制的同时,NOx的污染严重性日渐显现,于是大量控制煤粉氮氧化物排放的方法与技术出现,但燃用无烟煤的W型火焰锅炉的NOx排放量远高于一般燃煤锅炉,由于无烟煤的燃烧特性和W炉的燃烧特点,还未出现有效的控制方法,于是了解无烟煤的燃烧和NOx排放特性,寻找有效的控制W型火焰锅炉燃用无烟煤的高NOx排放量的燃烧技术十分必要.

本文按照“无烟煤燃烧和NOx生成机理研究—无烟煤一维悬浮燃烧试验——W炉冷态模化试验和数值模拟计算—W炉热态模化试验”的研究思路探究了无烟煤和W炉内的燃烧特性以及W炉燃用无烟煤时NOx的生成与控制方法.

在热天平试验台上进行无烟煤燃烧动力学特性研究,并建立了综合燃烧评价模型,发现煤粉挥发分析出主要受煤质本身特性的影响,粒径对其影响甚微；无烟煤着火温度高,稳燃和燃尽性能一般,可燃性差；通过综合判别模型认定无烟煤为劣等燃烧效果的煤种.

在固定床试验台上进行了无烟煤燃烧特性和NOx生成规律研究.无烟煤的燃烧速度很慢,其NO生成率随温度的升高而降低；无烟煤本身的挥发分含量是其煤质特性中影响其NO生成率最关键的因素,其N含量与NO生成率并没有必然的联系,O含量对NO生成率的影响规律与挥发分类似.

利用固定床试验台对无烟煤燃料N的转化规律和其焦炭对NO的还原规律进行了研究,并对不同的研究方法进行了比对.在本文试验条件下,在1200℃,6%氧浓度和200-250目的煤粉粒径下,无烟煤挥发分N的转化率最低,而对于焦炭N来说,在1200℃,1%氧浓度和粒径为250-300目的条件下时转化率最低,1000℃的制焦温度对于控制NO生成来说是最差的；无烟煤燃料型NO中,焦炭NO占绝大部分；煤粉挥发分N向NO的转化率要高于燃料N,焦炭N最低；在800℃下制得的无烟煤焦炭在1200℃和粒径为200-250目条件下时还原活性最强；燃烧排放气体中的CO/CO2值越大表明焦炭还原效果越差；在条件相同的情况下,烟煤焦炭对NO的还原效果要优于无烟煤焦炭,这是同等工况下无烟煤燃烧NO生成率要高于烟煤的关键原因.

基于固定床试验结论,建立了简化的燃料N转化模型和焦炭还原NO模型.燃料N转化模型可以准确地定性预测不同燃烧条件下燃料N的转化规律,发现在不同的燃烧条件下,对燃料N转化起主导作用的反应不相同；在焦炭还原NO模型中,发现公式RNO等于4.18×,10-4exp(-17500/T)A() PNO更适合用于计算焦炭还原NO量.

在一维沉降炉试验台上,对无烟煤在实际悬浮燃烧过程中的燃烧特性及NOx排放特性进行试验研究.燃用无烟煤时,最佳的炉内温度在1400-C左右,如采用空气分级燃烧,主燃烧区域过量空气系数应选择0.8-0.9附近,燃尽区域则应选择在1.1附近；采用一维沉降炉燃用无烟煤燃尽率低,可通过增加炉内停留时间来提高燃尽率,因而W炉是燃用无烟煤的最优选炉型.

根据机理研究和一维燃烧试验,简化燃料N转化过程中的复杂反应,建立了无烟煤一维燃烧燃料N的转化模型,得到的计算结果与实测结果较为吻和.通过该模型的应用发现,无烟煤粉粒径的变化对NO排放量的影响较小,在空气分级燃烧中主燃区过量空气系数控制在0.8-0.9之间较为适宜.

针对W炉燃烧特性,提出HAP低NOx燃烧技术.利用FLUENT计算软件,对采用该技术的W炉内流场进行模拟计算,并进行热态计算观察其对炉内温度场及NOx排放的效果,同时根据数值模拟计算结果选择性进行了冷态模化试验.试验结果认为HAP低NOx燃烧技术较一般W炉燃烧方法有效优化炉内流场,改善炉内结渣情况,并可较大幅度降低NOx排放量；侧墙风喷口处于较高位置,下倾角度为36°,,冷灰斗风喷口处于较低位置,上倾角度为90°,时既可得到较长的主气流射流深度和较高的下炉膛充满度,又可以尽可能减少炉内结渣危险性.

在国内最大的3.5MWe W炉热态模化试验台上,改造后进行热态模化试验,研究各种因素对炉内燃烧和NOx排放的影响,并对不同的W炉空气分级燃烧技术进行对比.不同的W炉空气分级燃烧技术中,带有OFA独立布置的燃烧技术要优于将乏气喷口置于上炉膛侧墙的燃烧技术,除去极限工况的情况下,通过燃烧调整NOx排放量最多可降低33.39%.HAP低NOx燃烧技术是一种适用于W炉燃用无烟煤且可在不降低燃烧效率的情况下有效降低NOx排放量的技术.

第五篇博硕士论文范文格式：极化电荷的发展、应用以及生物大分子体系分子动力学模拟的研究

分子动力学模拟可以用来研究生物大分子体系的各种性质,如：预测受体和配体之间的亲和力,模拟蛋白质的折叠过程,研究蛋白质与细胞膜之间的相互作用、离子通道以及酶的催化反应等等,因此逐渐受到科学家的重视.分子动力学模拟理论将每个原子看成一个球,原子与原子之间通过弹簧连接,模拟体系在高维的势能函数面上运动.目前,存在多种不同的势能函数,如：AMBER, CHARMM,OPLS等,所有的势能函数都可划分成两大类：通过共价键相互作用的势能和非共价键作用的势能,共价键作用能包含键的伸缩能,角的弯曲能,二面角的扭转势能,非共价键作用能包含静电作用能和范德华作用能,势能函数中不同的参数形成不同的分子力场.静电作用是一种长程作用力,对动力学模拟的结果具有重大的影响,静电作用力的正确与否直接关系到氢键、盐桥等作用力的合理性,而大量研究证明氢键和盐桥对蛋白质折叠、配体和受体相互作用等都具有非常重要的意义.目前所有的力场都是采用库伦定律来计算静电作用能,分子理论假设每个原子上的电荷都集中在原子的中心,通过拟合分子周围的电势得到每个原子上的电荷.传统分子力场中,每个氨基酸上的原子电荷为一个定值,不受周围环境的影响.而实际上,生物大分子的一切运动都离不开水溶液,水分子为极性分子与生物大分子之间存在明显的极化效应,因此我们在分子动力学模拟的时候必须考虑生物大分子与周围环境之间的极化作用.

经过长期的努力,目前已发展了多种极化电荷模型,主要有：Drude振子模型,涨落电荷模型和诱导多极模型.但是这些方法仍然存在一些无法避免的缺陷,如：Drude振子模型引入了人为的参数,诱导多极模型的计算量非常大,目前根本无法与分子动力学模拟结合,而且力场的可迁移性也很难实现.我们课题组完全放弃了力场的可迁移性,运用分子碎片共轭帽法,将量化计算的方法引入到生物大分子的电势计算过程中,在计算电势的同时考虑了周围环境与生物大分子之间的极化效应,最后对电势进行拟合得到生物大分子的极化电荷.借助RESP方法拟合的蛋白质内部原子的极化电荷随构象的变化波动幅度较大,非常不利于分子动力学模拟,特别是在QM/MM模拟等过程中,可能存在大构象的变化,因此大幅度的电荷涨落,对模拟非常的不利.基于2011年张等人选择参考电荷将偶极矩进行分割的方法,本文在RESP方法的基础上发展了一套在数值上更稳定的拟合极化电荷的方法：dRESP方法.dRESP方法中,每个原子上的电荷被划分成两部分：参考电荷和需要拟合的电荷.此方法的前提是参考电荷能够近似描述原子的电荷分布,所以参考电荷一般为MBER、CHARM、OPLS等力场中常用的电荷.量化计算的电势与参考电荷在相同格点上产生的电势之间的差量就是我们需要拟合的电荷在这个格点上产生的电势,拟合这个电势就能得到一个差值电荷.在拟合的过程中,我们在每个原子上所加的限制都是不同,与其参考电荷平方的倒数成正比,最后参考电荷与拟合得到的差值电荷之和就是整个原子的电荷.通过这种方式拟合电荷的优势是：拟合的电荷比原子电荷小了几个数量级,因此造成的数值误差比直接拟合原子的电荷要小很多.计算结果证明参考电荷的选取不影响拟合电荷的波动性,这种分步拟合电荷的方法的确很大程度上避免了拟合过程中出现的数值问题.

Streptavidin与biotin之间的结合自由能高达-18.1kcal/mol,是目前发现的自然界中亲和力最强的化合物,对合理药性物设计具有很高的研究价值.大量研究证明氢键网络对biotin与streptavidin之间的结合非常重要,然后Baugh等人发现streptavidin末端的130号氨基酸由PHE突变成LEU之后,结合自由能减少了4.2kcal/mol,但是结构却没有明显的变化,突变前后A链上Ca原子的RMSD值仅为0.377A.我们同时运用AMBER电荷和dRESP方法拟合的极化电荷对streptavidin突变前后与biotin的复合物进行分子动力学模拟,并借助MM/PBSA方法预测原生态和130氨基酸突变体系的结合自由能.AMBER电荷的计算结果发现biotin与streptavidin之间的亲和力为正值,两者无法自由结合,同时计算的突变引起的能量差与实验值相比也过低.dRESP极化电荷加强了biotin与streptavidin之间的结合能,计算的绝对结合能和原生态与突变态之间的相对能量都与实验值一致.我们的计算证明了Baugh等人的猜测：静电极化效应是引起130号氨基酸突变能量变化的主要原因.

CYP是一大类单氧酶,涉及到70-80%药物的前期代谢反应,因此对药物-药物相互作用具有重大的影响.CYP2J2是CYP酶家族的一类子族,主要表达在小肠,心血管等肝外器官中,大量研究证明CYP2J2能够催化大部分的药物,是药物前期代谢必不可少的一种酶,也可能会涉及到药物-药物相互作用,但是CYP2J2药物代谢的机理还不明了.分子对接是计算机辅助药物设计的主要手段,结合实验、分子对接、分子动力学模拟等技术,我们从69种已知的药物中筛选到两种CYP2J2有效的抑制剂：telmisartan、flunarizine、telmisartan和flunarizine对CYP2J2的半抑制剂浓度分别为0.42声μM和0.94μM,而对CYP家族其它成员的活性几乎没有影响,同时我们还证明这两种抑制剂不是CYP2J2的底物,是研究CYP2J2药物代谢机理最理想的工具.分子对接和动力学模拟进一步证实了实验的结论,并在原子结构的级别上展示telmisartan是非竞争性抑制剂,flunarizine是竞争性的抑制剂.

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